fr.wedoany.com Rapport : Lors des discours d’ouverture du deuxième jour du congrès Bio-IT World 2026, plusieurs experts ont exploré les applications des modèles fondamentaux et de l’apprentissage fédéré dans la découverte de médicaments. Le panel comprenait le Dr Woody Sherman, fondateur et directeur de l’innovation de PsiThera, le Dr Mohammed AlQuraishi, professeur adjoint de biologie des systèmes à l’Université Columbia, le Dr Jonathan Gilbert, directeur principal de la croissance de l’écosystème et de la collaboration avec les contributeurs chez Eli Lilly, le Dr José-Tomás Prieto, directeur des projets IA chez Apheris, le Dr Arman Zaribafiyan, responsable des alliances stratégiques en simulation IA chez SandboxAQ, et le Dr Christina Taylor, chercheuse scientifique senior et responsable de la conception moléculaire computationnelle chez Bayer.

Sherman a souligné que les plateformes ouvertes contribuent à faire progresser le domaine de la découverte de médicaments, et que l’industrie devrait construire ensemble des modèles fondamentaux, puis utiliser l’apprentissage fédéré pour les optimiser davantage.

AlQuraishi a noté qu’AlphaFold a considérablement accéléré les progrès dans la prédiction des structures protéiques à court terme, mais que la modélisation de ses composants non protéiques reste limitée. Il a présenté OpenFold comme une alternative open source à AlphaFold, composée de plus de 40 institutions, visant à fournir une plateforme publique reproductible. OpenFold est à la fois une boîte à outils et une alliance académico-industrielle, offrant à l’industrie un mécanisme orientable.

Gilbert a expliqué qu’Eli Lilly a lancé la plateforme TuneLab en 2025, offrant gratuitement des modèles d’IA aux entreprises de biotechnologie, à condition qu’elles contribuent des données d’entraînement. La valeur des données investies par Lilly dans l’entraînement des modèles dépasse le milliard de dollars. La plateforme compte actuellement plus de 75 partenaires, utilisée dans des dizaines de pays sur trois continents. Lilly a également conclu un accord avec Collaborative Drug Discovery (CDD) pour intégrer TuneLab dans la plateforme CDD Vault.

Prieto a abordé la complexité de la mise en œuvre de l’apprentissage fédéré, soulignant que le nouveau paradigme ne nécessite pas de centralisation de la préparation des données, chaque entreprise devant coordonner les normes et les environnements de calcul. Le réseau de biologie structurale basé sur l’IA soutenu par Apheris rassemble plusieurs des 20 plus grandes entreprises biopharmaceutiques, permettant aux modèles d’IA de s’entraîner sur des données protéiques propriétaires tout en garantissant la sécurité des données.

Zaribafiyan a souligné que le réglage fin peut réduire considérablement l’écart entre les modèles génériques et les cas réels de découverte de médicaments. SandboxAQ collabore avec OpenFold et a annoncé le lancement d’une nouvelle plateforme qui relie des modèles quantitatifs à de grands modèles de langage, permettant aux scientifiques d’utiliser le langage naturel pour lancer des simulations et des workflows.

Taylor a noté que les modèles fondamentaux pilotés par la communauté accélèrent l’innovation dans le domaine de l’IA biomoléculaire. Bayer utilise ces modèles pour résoudre des structures cristallines, améliorer le développement de médicaments et les caractéristiques des sciences des cultures, ainsi que pour étudier les interactions protéiques et simuler la catalyse enzymatique.

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