fr.wedoany.com Rapport : NVIDIA a dévoilé BioNeMo Agent Toolkit, une suite d'outils professionnels et de modèles ouverts accumulés depuis plus de dix ans pour les agents d'IA dans le domaine des sciences de la vie. Elle permet aux agents, scientifiques et laboratoires de collaborer en collectant des preuves, en raisonnant sur les résultats de découvertes, en exécutant des expériences computationnelles et en recommandant les meilleures étapes suivantes pour accélérer la découverte scientifique.

Ce kit intègre les bibliothèques, outils et modèles ouverts des sciences de la vie accumulés par NVIDIA depuis plus de dix ans. Il fournit à tout agent ou plateforme d'IA — y compris les assistants généralistes, les agents scientifiques spécialisés, les plateformes logicielles et les systèmes biopharmaceutiques internes — les outils nécessaires pour synthétiser et résumer les connaissances scientifiques, appeler des modèles, évaluer les résultats, raisonner et exécuter des actions ultérieures. Le kit inclut NVIDIA BioNeMo et est soutenu par les microservices NVIDIA NIM, NVIDIA Parabricks, NVIDIA NeMo et NVIDIA Nemotron, ainsi que par l'informatique accélérée et les compétences, établissant ainsi une base ouverte et fiable pour les sciences de la vie agentiques.
Plus de 50 entreprises leaders utilisent déjà ce kit pour faire progresser les découvertes scientifiques, en exploitant les compétences appelables par les agents pour accomplir des tâches telles que la prédiction de structures protéiques, le docking moléculaire, la chimie générative, l'analyse génomique, la conception de protéines et la découverte de biomarqueurs. Jensen Huang, fondateur et PDG de NVIDIA, a déclaré que les modèles de pointe sont le cerveau et que BioNeMo est la boîte à outils scientifique. Leur combinaison confère aux agents d'IA les compétences d'un assistant de recherche doctorant et la vitesse d'un supercalculateur. Pour la première fois, les chercheurs peuvent construire des agents d'IA capables de comprendre les connaissances scientifiques, d'utiliser des outils scientifiques et d'exécuter des flux de travail scientifiques. Il s'agit d'une nouvelle approche scientifique qui peut considérablement accélérer les découvertes en biologie, chimie, génomique et médecine.
Des modèles ouverts et des instituts de recherche, notamment l'Arc Institute, l'Open Molecular Software Foundation et l'Institute for Protein Design (IPD) de l'Université de Washington, collaborent avec NVIDIA pour faire progresser les modèles de pointe via BioNeMo et rendre ces modèles plus accessibles grâce à des flux de travail prêts pour les agents. La collaboration avec l'IPD a déjà accéléré le temps d'exécution de modèles avancés de conception biologique comme RosettaFold3, avec des performances deux fois supérieures à celles des modèles précédents, et d'autres applications pour accélérer la conception de protéines sont en cours. David Baker, professeur de biochimie à l'École de médecine de l'Université de Washington et directeur de l'Institute for Protein Design, a déclaré que chaque outil qu'ils construisent pour la conception de protéines n'est efficace que si les scientifiques peuvent l'utiliser efficacement. Le prochain bond en avant scientifique ne viendra pas d'une découverte unique, mais de la vitesse de conception itérative et d'agents capables de réfléchir à la complexité de la biologie à une vitesse que les humains ne peuvent atteindre.
Les investissements mondiaux en R&D scientifique dans les sciences de la vie s'élèvent à 3 800 milliards de dollars, avec un budget pharmaceutique annuel proche de 300 milliards de dollars. Les flux de travail agentiques peuvent aider l'industrie à itérer plus rapidement tout en réduisant les coûts et en maximisant les chances de succès. Grâce à ce kit, les développeurs peuvent transformer un agent généraliste en agent des sciences de la vie en quelques minutes, permettant aux chercheurs d'exécuter des expériences plus rapidement et d'apprendre continuellement des résultats. Les agents généralistes peuvent rencontrer des difficultés à naviguer efficacement dans les flux de travail scientifiques, nécessitant de déduire les bons outils, entrées, sorties et implications biologiques. Ce kit aide les agents à appeler les bons outils, à interpréter les résultats plus précisément et à obtenir des insights scientifiques plus rapidement. NVIDIA optimise l'ensemble de la plateforme BioNeMo en transformant les bibliothèques, modèles et frameworks en outils appelables par les agents, en utilisant des technologies telles que les modèles ouverts NVIDIA Nemotron, la bibliothèque NVIDIA NeMo RL, le blueprint NVIDIA NemoClaw et l'environnement d'exécution NVIDIA OpenShell. Les flux de travail pris en charge par les composants du kit incluent : le criblage virtuel, qui aide les chercheurs à identifier des candidats médicaments à petites molécules en générant et filtrant des composés, en les dockant sur des cibles, en prédisant la force de liaison et en filtrant les propriétés de type médicament, réduisant le temps de criblage de plusieurs jours à quelques minutes ; l'analyse génomique et la découverte de cibles, qui utilisent NVIDIA Parabricks pour accélérer l'alignement et la détection de variants, les modèles fondamentaux génomiques évaluant les effets des variants et les agents classant les candidats pour les maladies les plus pertinentes ; la conception de liants protéiques, qui permet de concevoir et valider des candidats de manière computationnelle, compressant le travail de conception traditionnellement intensif ; la recherche biomédicale approfondie, qui connecte les données du monde réel aux modèles de raisonnement, y compris la revue de littérature, la génération de protocoles, le criblage d'essais cliniques et la pharmacovigilance via l'agent NVIDIA Biomedical AI-Q Research ; et l'analyse d'imagerie médicale, qui aide à traiter, segmenter, synthétiser et raisonner sur les données d'imagerie médicale pour soutenir la découverte de biomarqueurs.
Des entreprises des écosystèmes technologiques et des sciences de la vie utilisent ce kit pour faire progresser les flux de travail agentiques. Les laboratoires de pointe et les constructeurs d'agents scientifiques, notamment Anthropic, Edison Scientific, Lila Sciences, OpenAI et Owkin, intègrent BioNeMo pour aider les agents à passer de la réponse à des questions à l'exécution de travaux scientifiques. Les plateformes de données scientifiques et de flux de travail de Benchling, Certara, Databricks, Snowflake et Seqera utilisent ce kit pour connecter les systèmes de données à la science pilotée par l'IA, les compétences aidant les agents à interroger des ensembles de données biologiques et chimiques, à préparer des entrées prêtes pour les modèles, à lancer des flux de travail reproductibles, à analyser les sorties et à renvoyer des insights. Les entreprises de diagnostic et pharmaceutiques, notamment Lilly et Natera, utilisent ce kit pour étendre les flux de travail agentiques reproductibles couvrant la découverte, la recherche translationnelle et les insights cliniques. Les entreprises de biologie native à l'IA, notamment Boltz, Basecamp Research, Chai Discovery, Dyno, PerturbAI et Proxima, collaborent avec NVIDIA pour développer des outils accélérant les flux de travail de conception thérapeutique pilotés par modèles. Les fournisseurs de logiciels de découverte de médicaments assistée par ordinateur, notamment Dassault Systèmes, Cadence (OpenEye) et Schrödinger, intègrent les fonctionnalités de ce kit pour permettre aux agents de coordonner la génération, le docking et la prédiction de molécules. Les entreprises d'instruments de laboratoire et d'automatisation, notamment Automata, HighRes, Tecan, Thermo Fisher, ainsi que la plateforme de génération de données autonome Medra, connectent leurs systèmes à la découverte computationnelle soutenue par les compétences BioNeMo. Les entreprises de cloud IA et d'infrastructure IA, notamment Baseten, Modal et Nebius, utilisent ce kit pour soutenir les compétences et outils BioNeMo via des interfaces de programmation d'applications évolutives, l'informatique hébergée et des environnements d'inférence de production, aidant à transformer les flux de travail biologiques agentiques du prototype au service.
BioNeMo Agent Toolkit et ses compétences sont désormais disponibles via la page des ressources développeurs de NVIDIA et GitHub.
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