fr.wedoany.com Rapport : L'équipe d'innovation en recherche et développement de technologies génomiques agricoles de l'Institut de génomique agricole de l'Académie chinoise des sciences agricoles a mis au point une nouvelle méthode d'analyse d'association pangénomique pour les polyploïdes, résolvant ainsi le problème de l'analyse génétique des génomes polyploïdes complexes. Les résultats de cette recherche ont été publiés dans Nature Genetics.

Les génomes polyploïdes contiennent plusieurs ensembles de chromosomes homologues hautement similaires. Les analyses d'association pangénomique traditionnelles nécessitent d'abord un alignement précis des fragments séquencés sur le génome de référence, puis l'identification des génotypes individuels. Cependant, en raison de la forte similarité des chromosomes homologues, les fragments sont souvent mal positionnés, ce qui entraîne des résultats d'analyse faussés.

Pour résoudre ce problème, l'équipe de recherche a proposé une nouvelle méthode d'analyse d'association pangénomique pour les polyploïdes qui ne dépend pas de l'alignement sur une séquence de référence. Cette méthode contourne les étapes fastidieuses d'assemblage et recherche les gènes clés associés aux caractères en « comptant » les fragments génétiques. Cette technologie a été validée chez le riz diploïde, la luzerne tétraploïde, la patate douce hexaploïde et la canne à sucre cultivée polyploïde, et a permis d'identifier les gènes clés contrôlant l'accumulation de sucre et le tallage dans des populations complexes de canne à sucre sauvage. Cette étude fournit un outil puissant pour la sélection assistée par conception précise des cultures polyploïdes et devrait accélérer le processus de sélection de variétés améliorées.

Cette recherche a bénéficié du soutien de la Fondation nationale des sciences naturelles de Chine et du Programme d'innovation scientifique et technologique de l'Académie chinoise des sciences agricoles.